L'église paroissiale d'Iznajar dédiée à l'apôtre Jacques se situe dans la partie la plus haute du village, à l'intérieur de l'enceinte de la Villa médiévale. Elle fût construite dans le but d'ériger une église en grandes proportions, mais elle n'a jamais pu être terminée. La construction eut lieu durant l'époque du style de la renaissance, entre 1547 et 1638 par Hernan Ruiz el Joven. Une grande réforme intérieure et extérieure fut effectuée entre 2005 et 2008. Durant l'intervention intérieure, les murs du temple étant peints à la chaux, les murs de pierre furent mis à nu. Derrière la chaux apparurent des fresques originales du 17e siècle sur les latéraux proches de l'autel.
L'église souffre de problèmes de structure depuis le début de sa construction. Au 18e siècle, un grand arc-boutant fut érigé pour contenir le coin de la croix opposée à la tour. Sous le mur du croisement du côté de l'épitre se trouve une grande citerne sous une structure d'arques. Durant un certain temps l'eau se récoltait dans l'église, jusqu'à ce qu'en 1595 la citerne fût adaptée pour pouvoir être utilisée depuis la rue.
Le temple est conçu d'une seule nef, caractérisée par une abside semi-circulaire et une croisée spacieuse dont la nef est relativement courte mais plus large que la nef principale, restée inachevée. Le presbytère est relativement haut, avec 1m40 de hauteur. La prolongation de l'église s'est faite à base de murs de maçonnerie avec des lignées de briques de triple feuille et de murs d'une hauteur moindre que le reste et le tout en général d'aspect très pauvre. L'abside est couverte d'une semi-coupole à caissons, suivant un type répétitif de l'école Siloe.
Le Grand Retable, de style Baroque présente une bonne taille et fut construit entre 1749 et 1760 par Cécilio Antonio Franco Roldan, retable doré par l'artiste lucenien Juan Ramirez de Zuñiga en 1789.
A l'extérieur, l'église présente un aspect noble avec une architecture faite de parpaing de pierre. La tour est constituée d'un grand prisme de pierre, dont la structure s'est fragilisée avec le temps. Sa construction est aussi restée inachevée et il lui a été ajouté un corps de cloches en briques sans décorations. L'intérieur du clocher représente une structure particulière de par les variations d'hauteurs dues à l'inclinaison du terrain. L'arraché de la tour est plus bas que le niveau de l'église, où se trouve une sorte de sous-sol voûté, au dessus duquel se trouve la sacristie et plus haut un autre espace avec des voûtes en segments.